Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPF2Q9HAU5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms