Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCL3Q9H2J4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms