Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2OQ9C0C9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE2OQ9C0C9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE2OQ9C0C9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE2OQ9C0C9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE2OQ9C0C9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2OQ9C0C9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2OQ9C0C9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2OQ9C0C9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2OQ9C0C9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2OQ9C0C9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2OQ9C0C9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2OQ9C0C9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2OQ9C0C9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms