Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IFIH1Q9BYX4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms