Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF17Q9BXT8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF17Q9BXT8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms