Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THUMPD2Q9BTF0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THUMPD2Q9BTF0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms