Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GINS3Q9BRX5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GINS3Q9BRX5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms