Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALS2CR12Q96Q35 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALS2CR12Q96Q35 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms