Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf42Q96LP6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms