Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TPD52L3Q96J77 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TPD52L3Q96J77 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms