Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALML4Q96GE6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALML4Q96GE6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALML4Q96GE6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALML4Q96GE6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms