Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BICD1Q96G01 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BICD1Q96G01 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms