Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DNAJA3Q96EY1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms