Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RNF183Q96D59 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RNF183Q96D59 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RNF183Q96D59 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RNF183Q96D59 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RNF183Q96D59 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RNF183Q96D59 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RNF183Q96D59 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RNF183Q96D59 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF183Q96D59 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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