Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLUAP1Q96AJ1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLUAP1Q96AJ1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLUAP1Q96AJ1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLUAP1Q96AJ1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLUAP1Q96AJ1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLUAP1Q96AJ1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLUAP1Q96AJ1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLUAP1Q96AJ1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLUAP1Q96AJ1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLUAP1Q96AJ1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLUAP1Q96AJ1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLUAP1Q96AJ1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms