Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HPS3Q969F9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms