Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERCC4Q92889 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC4Q92889 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms