Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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RABGGTAQ92696 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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RABGGTAQ92696 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RABGGTAQ92696 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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RABGGTAQ92696 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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RABGGTAQ92696 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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RABGGTAQ92696 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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RABGGTAQ92696 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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RABGGTAQ92696 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RABGGTAQ92696 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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