Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGDCC4Q8TDY8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGDCC4Q8TDY8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms