Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC21AQ8NDW8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC21AQ8NDW8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
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