Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FSIP1Q8NA03 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FSIP1Q8NA03 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms