Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP2LQ8IYA6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms