Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2Q1Q7Z7E8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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