Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDXQ7Z353 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDXQ7Z353 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms