Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HACD2Q6Y1H2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HACD2Q6Y1H2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms