Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMCO3Q6UWJ1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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