Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZBED9Q6R2W3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZBED9Q6R2W3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms