Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMOD2Q6P5Q4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms