Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 PRKAB2-202ENST00000474939 578 ntTSL 49.88□□□□□ -0.832e-8■■■■■ 37.1
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PRPF8Q6P2Q9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.534e-10■■■■■ 37.1
PRPF8Q6P2Q9 MECR-212ENST00000478505 857 ntTSL 59.87□□□□□ -0.834e-10■■■■■ 37.1
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PRPF8Q6P2Q9 BCOR-204ENST00000378463 2230 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.023e-7■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.416e-9■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.566e-9■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 SRSF11-204ENST00000395136 1408 ntTSL 1 (best)22.15■■□□□ 1.146e-8■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 SRSF11-212ENST00000475204 760 ntTSL 519.63■□□□□ 0.732e-12■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 SRSF11-215ENST00000486667 662 ntTSL 58.26□□□□□ -1.092e-12■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 36.9
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PRPF8Q6P2Q9 ABR-214ENST00000571797 850 ntTSL 414.79□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 ABR-212ENST00000571383 557 ntTSL 410.8□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 ABR-210ENST00000571120 551 ntTSL 410.46□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 ABR-218ENST00000572585 3776 ntTSL 29.2□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 ABR-209ENST00000571022 551 ntTSL 44.17□□□□□ -1.742e-6■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.111e-9■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.081e-9■■■■■ 36.9
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