Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms