Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LEMD1Q68G75 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms