Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SAMD13Q5VXD3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAMD13Q5VXD3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms