Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms