Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FAM74A1Q5RGS3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms