Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HABP4Q5JVS0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms