Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL22Q53GT1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms