Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC38Q502W7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms