Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SP6Q3SY56 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP6Q3SY56 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms