Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HFEQ30201 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HFEQ30201 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HFEQ30201 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HFEQ30201 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HFEQ30201 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HFEQ30201 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HFEQ30201 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HFEQ30201 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HFEQ30201 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HFEQ30201 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HFEQ30201 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HFEQ30201 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HFEQ30201 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HFEQ30201 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HFEQ30201 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HFEQ30201 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HFEQ30201 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HFEQ30201 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HFEQ30201 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HFEQ30201 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms