Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSPP1Q1MSJ5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms