Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRNQ16849 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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PTPRNQ16849 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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PTPRNQ16849 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRNQ16849 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRNQ16849 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRNQ16849 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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PTPRNQ16849 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPRNQ16849 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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