Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VAMP3Q15836 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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VAMP3Q15836 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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VAMP3Q15836 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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