Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDSNQ15517 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms