Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRD3Q15059 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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BRD3Q15059 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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BRD3Q15059 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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BRD3Q15059 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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