Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR1D2Q14995 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR1D2Q14995 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms