Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CIRBPQ14011 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms