Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6HQ13956 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6HQ13956 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6HQ13956 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6HQ13956 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PDE6HQ13956 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6HQ13956 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PDE6HQ13956 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6HQ13956 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PDE6HQ13956 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6HQ13956 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PDE6HQ13956 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PDE6HQ13956 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDE6HQ13956 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDE6HQ13956 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PDE6HQ13956 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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PDE6HQ13956 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PDE6HQ13956 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDE6HQ13956 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDE6HQ13956 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PDE6HQ13956 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDE6HQ13956 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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