Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALCAMQ13740 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ALCAMQ13740 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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