Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B2Q13435 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B2Q13435 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
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