Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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PTP4A2Q12974 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTP4A2Q12974 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTP4A2Q12974 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTP4A2Q12974 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTP4A2Q12974 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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PTP4A2Q12974 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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PTP4A2Q12974 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTP4A2Q12974 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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